近日,國內(nèi)首個乙型肝炎病毒基因多功能共享數(shù)據(jù)庫在解放軍302醫(yī)院建成并投入使用,其收錄了我國10000余例患者乙型肝炎病毒基因序列、基因克隆和相關臨床資料,具有較強的生物信息學分析功能,為研究我國患者乙型肝炎病毒基因變異與耐藥、分子致病機制、疫苗設計和免疫應答等提供了共享信息平臺,也可為臨床合理制訂抗病毒治療方案提供幫助。
據(jù)全軍傳染病研究所副所長、解放軍302醫(yī)院徐東平研究員介紹,這個數(shù)據(jù)庫具有序列數(shù)據(jù)量大、數(shù)據(jù)資源免費共享的特點,并可系統(tǒng)地檢測和監(jiān)控核苷(酸)類抗病毒藥物耐藥變異;此外,該數(shù)據(jù)庫還在不斷收錄新的病例資料和序列信息,具有可擴充性。該數(shù)據(jù)庫目前已收錄了2000多個代表性病毒基因克隆,收錄了耐藥變異、抗病毒藥物治療和臨床應答指標等相關信息。
數(shù)據(jù)庫具有多種實用生物信息學分析功能,包括序列相似性比對、基因亞型分析、HBV血清型分析、核苷類似物耐藥位點分析、特異性T淋巴細胞表位分析、病毒基因組系統(tǒng)進化樹分析以及個性化數(shù)據(jù)篩選分析功能,能從核酸和蛋白兩個層次,對HBV各個功能區(qū)不同長度的序列多態(tài)性進行統(tǒng)計。數(shù)據(jù)庫已在多家醫(yī)療與科研單位進行了應用,取得了預期效果,目前已正式聯(lián)網(wǎng)運行。